סטודנט באוניברסיטת בן-גוריון, יואב שמחוני, יועמד בקרוב לדין משמעתי בגלל שהשתתף בהפגנה למען חופש ביטוי בקמפוס. זהו מקרה נוסף של סתימת פיות בתוך הקמפוס ומחוצה לו, בסיוע של משטרת ישראל, הכולל מעצר פעילים ופעילות של אנשי מחלקת הביטחון שמשטרה פוליטית לכל דבר. עודף פעילות מחלקת הביטחון מטריד גם את המרצים. 60 מרצים ו-60 סטודנטים חתמו על מכתב אל הנהלת האוניברסיטה בו הם מביעים דאגה מהתנהלות המחלקה. "המקרים שדווחו", נאמר במכתב, "מעידים על דפוס פעולה פסול, על התנהגות מפלה ואנטי-דמוקרטית ועל חוסר הבנה בסיסית לגבי מהות תפקידה של מחלקת ביטחון".
בעובדי מחלקות הביטחון באוניברסיטאות ממונים בדרך כלל על בדיקת תיקי הנכנסים ואבטחת אירועים, אבל באוניברסיטת בן-גוריון נמצא להם תפקיד מקורי נוסף: תיעוד פעילי שמאל ברחבי הקמפוס ומחוצה לו. מעדויות סטודנטים עולה כי אנשי מחלקת הביטחון נוהגים לצלם פעילים פוליטיים, וכן למנוע מסטודנטים לערוך פעילות פוליטית גם מחוץ לשערי האוניברסיטה.
סטודנט לתואר ראשון ופעיל חד"ש, דאוד עפאן, סיפר כי בתקופת המלחמה בעזה ישב בקפיטריה עם כמה מחבריו. "פתאום ניגשו אלינו אנשי מחלקת הביטחון, נפתלי פרסלר וגלעד טהלקר. הם ביקשו מאתנו להראות להם תעודות סטודנט ולאחר מכן צילמו אותי". באמצע חודש מאי, ארגן עפאן הרצאה לסטודנטים בנושא הנכבה. לאחר שקיבל את אישור דיקנאט הסטודנטים ואת אישורה העקרוני של מחלקת הביטחון, נאמר לו כי עליו לגשת אל משרדי המחלקה כדי לקבל אישור סופי. כשניגש עפאן למשרדים, הודיע לו פרסלר כי האירוע מבוטל מפני שאיחר בעשר דקות. בהתערבות דיקאן הסטודנטים התקיים לבסוף האירוע באיחור של שבוע. בתום האירוע אף גבו ממנו אנשי המחלקה תשלום על סך 118.3 ש"ח, מבלי להסביר לו בעבור מה. רק לאחר התערבות דיקאן הסטודנטים, יעקב אפק, התשלום בוטל.
סטודנט אחר לתואר ראשון, רן צורף, פעיל בארגון "דרום לשלום", סיפר לעיתון "הארץ" כי אנשי מחלקת הביטחון צילמו לפחות שלוש הפגנות בהן השתתף. התקרית האחרונה אירעה לפני כשבוע, כשעובד המחלקה צילם הפגנה שנערכה ביוזמת הסטודנטים של חד"ש נגד חוק הנכבה וחוק האזרחות מחלון בניין מרוחק כשהוא בלבוש אזרחי. צורף, שזיהה את העובד מהפגנות קודמות, צילם את הצלם, אך כשניגש לצלמו מקרוב איים עליו אדם אחר בלבוש אזרחי ש"יפרק אותו".
סטודנטית לתואר שני, נועה סלור, אף היא פעילת חד"ש, סיפרה כי לפני כחודש אנשי מחלקת הביטחון דרשו ממנה להפסיק לחלק עלונים נגד חוק הנכבה מחוץ לשערי האוניברסיטה. סלור הדגישה כי חברות מסחריות מחלקות עלונים כל העת במקום בו עמדה וכי היא עצמה חילקה שם בעבר הזמנות למסיבות. אנשי המחלקה הזמינו את המשטרה, ששלחה שישה שוטרים למקום כדי לעצור אותה. "יש תחושה לא נעימה של מין ק-ג-ב שפועל בתוך האוניברסיטה", אמרה סלור, "ללא נהלים כתובים ומבלי שאף אחד מפקח עליו או יודע מה הוא עושה". דובר האוניברסיטה מסר כי סלור עמדה תחת סככה שאכן נמצאת מחוץ לשער אך שייכת לשטח האוניברסיטה.
