האפיפיור פרנציסקוס מת הלילה בגיל 88, כך מסר הבוקר (שני) הוותיקן בהצהרה מצולמת. מותו של פרנציסקוס מסיים כהונה שארכה 12 שנים והתאפיינה לעתים בסערות בתוך הכנסייה הקתולית, מתחים וניסיונות לבצע רפורמות במוסד והתקפות בלתי פוסקו של גורמים שמרניים בכנסייה שאף כינו אותו "האפיפיור הקומוניסטי".
אמש בהופעתו האחרונה בכיכר פטרוס הקדוש במהלך מיסה לציון חג הפסחא התייחס למלחמות בעולם וקרא להפסקת אש מיידית בעזה. האפיפיור בירך את הקהל בברכה המסורתית "אורבי את אורבי" ואיחל לו "חג פסחא שמח", וזכה לתשואות. בגלל מצבו הבריאותי הקשה היה זה מנחה הטקס, הארכיהגמון דייגו ראוולי, שהקריא את נאום האפיפיור בו הביע סולידריות עם כאבם של הנוצרים בפלסטין ובישראל, קרא להפסקת אש ברצועה ולמתן סיוע הומניטרי לתושביה הפלסטינים. כמו כן, דרש את שחרור החטופים הישראלים והביע דאגה מול האנטישמיות הגואה בעולם.
ב-2014 ביקר פרנציסקוס בישראל, בשטחים הפלסטינים הכבושים ובירדן. בטקס קבלת הפנים שלו בנמל התעופה בן גוריון אמר פרנציסקוס בעוד שעל הפלסטינים להכיר בזכותה של ישראל לחיות בשלווה, על ישראל להכיר בזכותם של הפלסטינים למדינה ריבונית ועצמאית. הוא שב על אמרתו של קודמו בתפקיד, בנדקיטוס ה-16, לפיה "פתרון שתי המדינות חייב להפוך למציאות ולא להישאר חלום". הוא הוסיף כי השיח בין ישראל והפלסטינים "חייב להימשך כדי להשיג שלום כי אין דרך אחרת".
לאורך המלחמה בעזה גינה האפיפיור כמה פעמים את התקיפות האוויריות ברצועה — ואף גרר ביקורת רשמית מצד ממשלת הימין. את נאום חג המולד של 2024 פתח פרנציסקוס בגינוי ההפצצה הישראלית בעזה בסמוך לחג בה נהרגו עשרות פלסטינים. "אתמול הפציצו ילדים", אמר האפיפיור. "זו אכזריות. זו לא מלחמה. רציתי לומר זאת כי זה נוגע ללב".
עם מותו של פרנציסקוס, מסר יו"ר חד"ש-תע"ל ח"כ איימן עודה "יצא לי להכיר אישית את האפיפיור וקיימנו כמה פגישות. הוא תמך בזכויות הלאומיות של העם הפלסטיני ובמלחמה בעזה היה בין הראשונים השמיעו קריאה ברורה להפסקת אש ובגלל זה הותקף קשות בידי ממשלת הימין. הוא גם פעל כדי להגן על זכויות העובדים והמוחלשים. נוח על משכבך בשלום".