המשטרה פרצה סמוך לחצות בכוח רב למסגד אל-אקצא ופינה אותו מכל מתפלליו. המשטרה הסבירה כי הפריצה הייתה חוצה כדי לאפשר עליית היהודים והתיירים לאתר הקדוש לאסלאם בשעות הבוקר. החלטת המשטרה לפרוץ פנימה הציתה שרשרת אירועים שכללה מטחי רקטות לדרום הארץ ותקיפות חיל אוויר ברצועת עזה בערב פסח.
השוטרים פרצו למסגד תוך שימוש ברימוני הלם ובאלות. 350 איש נעצרו, הובלו באוטובוסים לבסיס מג"ב מחוץ לירושלים. לפי הסהר האדום הפלסטיני, 19 איש נפצעו. עם הפריצה המתפללים המוסלמים הפיצו סרטוני טיק-טוק ובהם נראים רימונים וזיקוקים מתנפצים במסגד, שוטרים מכים פלסטינים באלות, אש שפורצת ליד אחת הדלתות, חלונות מנופצים וזעקות. פרסום הסרטונים בעולם הערבי גרם לגל מחאות וגינויים כלפי ההתנהגותם של כוחות הכיבוש במסגד הקדוש למוסלמים.
חד“ש ומק"י גינו את ההתקפה נגד מסגד אל-אקצא והמתפללים והזהירו בפני תכניות ממשלת הימין להבערת האזור. בהודעה נאמר "ממשלת הכיבוש פוגעת במסגד אל-אקצא כסמל לריבונות הלאומית הפלסטינית. ההתקפה הינה המשך ישיר לרצח בדם קר של החלל ד"ר מוחמד אל-עסיבי ולהעלמת העובדות מזירת הפשע. פשעים אלה מאוששים את האזהרות מפני ניסיונות ממשלת הימין הקיצוני להימלט מהמשבר הפוליטי אמצעות התקפה נגד העם הפלסטיני. התקפה כזו עלולה להבעיר באש את האזור כולו".
גם ח"כ עופר כסיף (חד"ש) גינה את התקפת המשטרה במסגד אל-אקצא. בחשבון הטוויטר שלו כתב כסיף: "שוב השתוללות ברברית של כוחות הכיבוש באל-אקצא וברחבי ירושלים המזרחית והגדה הכבושות. ממשלת הדמים לא יודעת שובע וצמאה לעוד ועוד דם והקרבת קורבנות על מזבח אלילי הגזע והאדמה. ארורים תהיו". ח"כ עאידה תומא-סלימאן (חד"ש) הוסיפה "מראות נוראים מהפלישה למסגד אל-אקצא, התקפה האכזרית של המתפללים שכמאות מהם נעצרו בברוטאליות והושמו במחנה שהוקם במיוחד עבורם בעטרות וכל אחד מהם קיבל מספר; מעוררים זעם גדול אך מוכיח באותה נשימה שהממשלה הזו צועדת בבטחה לעבר הסלמה מתוכננת היטב ומגלה אדישות מוחלטת כלפי השלכותיה". "הקהילה הבינלאומית מחוייבת לפעול ולדרוש דין וחשבון על הכיבוש ופשעיו ולא, שתיקתה הרועמת תהווה אור ירוק להמשך הכיבוש ופשעיו ופלסטינים משני צידי הקו הירוק ימשיכו לשלם את המחיר", הדגישה.