זמן קצר לפני שהמדינה החלה להצביע במשאל עם על שינוי בחוקת המדינה, הודיעה ממשלת הונדורס כי הנשיא נעצר על ידי חיילים ונלקח לבסיס צבאי מחוץ לבירה. על כך מוסרות סוכנות הידיעות הקובנית "פרנסה לטינה", הסינית "סינחואה" ותחנת הטלוויזיה "טלסור".

נמסר כי בשעות אחר הצהריים (יום א') הנשיא חוסה מנואל סלאיה נעצר על ידי חיילי הצבא. אדוארדו ריינה, מזכירו האישי של סלאיה, סיפר כי הנשיא נעצר בשעה 7:00 בבוקר (שעה מקומית – אחה"צ על פי שעון ישראל)  והובא לבסיס חיל האוויר בפאתי הבירה טגוסיגלפה. לדבריו, במהלך המעצר נשמעו יריות. זמן קצר אחר כך, אישר רפאל אלגריה, החבר בממשלת הונדורס את דבר מעצרו של הנשיא. "שמענו שהוא הועבר לבסיס חיל האוויר", אמר בראיונות שהעניק לכלי התקשורת במדינה. "המדובר בהפיכה ימנית. זהו צעד מצער מאוד", הוסיף.

כתבי סוכנויות הידיעות סיפרו כי ראו עשרות חיילים מקיפים את ביתו של הנשיא בשעות הבוקר, ומאוחר יותר, נצפו עוזבים את המקום בכלי רכב צבאיים. כ-60 שוטרים עדיין שומרים על ביתו של הנשיא – אך הוא עצמו לא נראה. העיתון הספרדי "אל פאיס" דיווח כי עימותים פרצו ברחובות הבירה טגוסיגלפה בין תומכי סלאיה ומתנגדיו.

למרות התנגדות עזה למהלך בקרב חברי מפלגתו, בקונגרס, בצבא, ובבית המשפט העליון במדינה – החליט סלאיה לקיים את משאל העם על הרפורמה החוקתית במדינה. עם זאת, בית המשפט במדינה פסק כי למשאל העם לא יהיה כל תוקף חוקי. בשבוע שעבר פיטר סלאיה את מפקד הצבא במדינה, הגנרל רומיאו וסקס, לאחר שזה סירב לסייע לו בעריכת משאל העם ואיים בהפיכה.

סלאיה אמר בראיון שפורסם הבוקר ל"אל פאיס", בטרם הפיכה, כי אין לו כל כוונה להתמודד מחדש על הנשיאות – למרות שמפלגות האופוזיציה טוענות כי משאל העם נועד להשאירו בתפקיד גם אחרי הבחירות הכלליות הצפויות בנובמבר. "תקופת שלטוני תסתיים ב-27 בינואר 2010, אבל אני רוצה לאפשר לנשיא להיבחר מחדש בעתיד", מסר. עוד השיב הנשיא לשאלות הכתב הספרדי:

ש. אבל אתה לא איש שמאל, מפלגתך היא מפלגה שמרנית ובבחירות אתה הצגת את עצמך ככזה?

ת. נכון מאוד, באתי מהמגזרים השמרניים ביותר של הונדורס.

ש. ועכשיו אתה ניצב בקוטב ההפוך…

ת. … אני חייב להודות שרציתי לבצע כמה שינויים מבפנים, בתוך השיטה הניאו-ליברלית. אבל זה בלתי אפשרי. בעלי ההון אינם מוכנים לוותר ולו על דולר אחד. הם חומדים את כל העושר, ואינם מוכנים לוותר. הצורה היחידה כדי לקדם שינויים חברתיים היא לקרוא לדגל את העם.

ש. מי עומד מאחורי ניסיונות ההפיכה?

ת. לצערי, כל מנגנוני המשטר הקפיטליסטי: הצבא, המפלגות הגדולות, בית המשפט העליון. כולם גויסו כדי למנוע את השינויים חברתיים הנחוצים.

בהצהרה שפרסם נשיא ונצואלה, הוגו צ'אבס, ידידו הקרוב של סלאיה, הוא קרא לנשיא ארה"ב, ברק אובמה "להכריז על התנגדותו להפיכה ולהורות לכל מי שמעורב בה לחדול ממעשיו". "זו התקפה נגד העמים של הונדורס ושל אמריקה הלטינית כולה" הדגיש צ'אבס והוסיף "מי שעומד מאחורי ההפיכה היא הבורגנות. אלה בעלי הון הרוצים להפוך את הונדורס לרפובליקת בננות"