דאגה גוברת מהאווירה האנטישמית ושיכתוב ההיסטוריה של השואה המתרחשת כיום בליטא. קרוב לשנה מנהל התובע הכללי של ליטא חקירה כנגד ניצולי שואה על פעילותם כפרטיזנים במהלך המלחמה נגד הכובש הנאצי במסגרת הצבא האדום. אחד מהנרדפים הוא ד"ר יצחק ארד, לשעבר יו"ר יד ושם וחוקר שואה.

 

למרות מספר פעולות מחאה וצעדים שננקטו על ידי יד ושם וגופים נוספים, הרדיפות אחר פרטיזנים יהודיים נמשכות בליטא. כך גם תקריות אנטישמיות כגון ריסוס צלבי קרס וכתובות נאצה על קירות בנין הקהילה היהודית בליטא השבוע.

 

יו"ר יד ושם אבנר שלו שלח אמש (יום ב') מכתב לראש ממשלת ליטא, גדימינס קירקילס, בו נאמר: "עד עתה, לצערי, הזעקה הציבורית לא הצליחה להניב תגובה ליטאית הוגנת ואחראית. אם בכלל, נראה שהתופעה ההרסנית של רוויזיוניזם היסטורי  ועיוות,  כדוגמת  חקירת הפרטיזנים היהודים, נמצאת בעליה בארצך. לאור בעיה חמורה מתמשכת זו, יד ושם קורא לך להתערב באופן ישיר ולהשיב את יושרה וכבודה של ליטא כאומה נאורה ודמוקרטית על ידי סיום החקירות. רק על ידי התמודדות פתוחה וישרה עם כל האמת המורכבת בנוגע לעבר תצליח ליטא לבנות לעצמה עתיד בטוח ויציב", כתב שלו.

 

כמו כן, כתב שלו בשנית ליו"ר הוועדה ההיסטורית הבין-לאומית בליטא, עימנואליס זינגריס, ודחק בו להשמיע בפומבי את מחאתו נגד המצב.  בנוסף לפעולות מחאה שנקט יד ושם בשיתוף גופים אחרים, הוא השעה את חברותו בוועדה ההיסטורית הבין-לאומית בספטמבר 2007 ובפברואר 2008 הגיש יו"ר יד ושם מכתב מחאה לשר החוץ הליטאי במהלך ביקורו ביד ושם.